Wiele lat Krystyna Pisarkowa przepracowała w Instytucie Języka Polskiego PAN, wykładając jednocześnie na Uniwersytecie Śląskim i Jagiellońskim; pod koniec ubiegłego wieku przeniosła się całkowicie na UJ, na językoznawstwo ogólne i orientalistykę. Jako profesor gościnny wykładała w Saarbrucken, Moguncji i Wiedniu. W 1990 roku została powołana na członka korespondenta, a w 1994 roku na członka czynnego Polskiej Akademii Umiejętności. W 2003 roku prezes PAN powołał ją na członka Rady Języka Polskiego. Od 1963 roku współredagowała Język Polski, a w 2005 roku objęła stanowisko redaktora naczelnego tego pisma.